Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABARAPO95166 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GABARAPO95166 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms