Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL18O94889 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms