Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.5 ms