Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PROM1O43490 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms