Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GABRPO00591 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRPO00591 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms