Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms