Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCC2H7BZ55 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms