Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PCH4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PCH4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PCH4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PCH4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PCH4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PCH4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PCH4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PCH4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PCH4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PCH4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PCH4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms