Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms