Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms