Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ERVV-1B6SEH8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms