Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DXG7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DXG7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms