Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms