Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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