Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms