Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms