Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms