Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms