Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms