Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms