Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PKP3Q9Y446 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP3Q9Y446 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP3Q9Y446 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP3Q9Y446 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP3Q9Y446 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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