Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms