Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM35Q9UPQ4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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