Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms