Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAX2Q9UIW0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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