Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLKQ9UBT6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms