Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms