Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms