Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms