Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms