Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms