Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMC2Q9NRP2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMC2Q9NRP2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms