Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms