Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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