Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRDM12Q9H4Q4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms