Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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