Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUS3Q9BZE2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms