Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRRTQ9BXP5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRRTQ9BXP5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms