Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms