Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106CQ9BVX2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106CQ9BVX2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106CQ9BVX2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106CQ9BVX2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106CQ9BVX2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms