Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBF4Q9BQW3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms