Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms