Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USB1Q9BQ65 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USB1Q9BQ65 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms