Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms