Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms