Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARXQ96QS3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms