Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms