Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms