Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms