Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG3Q96JB2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms